在2004年的大事件"身份危机(Identity Crisis)"中，简杀死了伸缩人(Elongated Man)的妻子苏·迪布尼(Sue Dibny)。在偷走原子侠部分科技和制服以后，她为了让帕尔默回到她的身边而杀死了苏。她还安排了回旋镖队长(Captain Boomerang)袭击蒂姆·德雷克(Tim Drake)的父亲。而当时杰克·德雷克(Jack Drake)(红罗宾之父)的目的本是杀死某个随机的闯入者，结果他们两个互相杀死了对方。在将简送到阿卡姆疯人院后，帕尔默变到极小然后失踪了。
之后，瑞安·蔡(Ryan Choi)，一个曾与帕尔默邮件通信的香港物理系学生，找到了他制服和变小装置的复件成为了新的原子侠。同时，一个拥有跟帕尔默类似能力的少年以分子(Molecule)的名字加入了少年泰坦。在一个简短的任期之后，他在与恐怖泰坦(Terror Titans)的战斗中被杀。
在帕尔默失踪的这些年里，他的科技成果被超新星(Supernova)用于变小出入瓶中城坎多(bottle city of Kandor)。
虽然DC在帕尔默失踪后没有透露他的下落，但是，帕尔默还是在最终危机倒计时(Countdown)中回归并扮演了一个重要角色。一名监视者(Monitor)问起源之墙什么是"the great disaster"的解决办法，它回答"雷·帕尔默"。随后凯尔·雷纳(Kyle Rayner)，多娜·特洛伊(Donna Troy)和杰森·托德(Jason Todd)一起穿越多元宇宙去寻找帕尔默，基于他可能掌握了从这场危机中拯救现实的关键。
他们最终追踪到了51号地球，51号地球的帕尔默早就在研究多元宇宙并发现了逼近的危机后死去，主世界的帕尔默假装他过上了他的生活。四人组遇到了51号地球的简和正义联盟，发现这个世界里的英雄已经根除了超能力犯罪并建立了一个乌托邦(其实是因为蝙蝠侠在小丑杀死杰森以后干掉了这个世界上所有的超能力罪犯)。总而言之，凯尔，多娜，杰森和一个名为鲍勃(Bob)的监视者终于找到了他，鲍勃企图杀了帕尔默。在四人组的帮助下，帕尔默逃脱了，但也透露说51号地球的雷·帕尔默才是能够阻止危机的人，他一直试图继续51号地球帕尔默的工作，但无济于事。
所有人回到主世界之后，神奇玛丽(Mary Marvel)被达克赛德(Darkseid)黑化，然后绑架了吉米·奥尔森(Jimmy Olsen)。帕尔默进入了吉米的身体。在达克赛德控制吉米的超能力的时候，帕尔默定位并关掉了吉米脑内的控制器，但他瞬间被一堆Apokoliptian antibodies(天启星抗体)包围了。在躲避它们的攻击时，帕尔默发现了包含了新神(New God)的精神力量的"电池"。帕尔默把它从吉米的脑子里拿出来并粉碎了，释放了那些能量。
之后，帕尔默意识到地球上没有任何值得留恋的东西了，于是他加入了多娜，凯尔和Forager的多元宇宙守卫的使命。不过，帕尔默在发现他的老对手克罗诺斯(Chronos)用他的身份误导了一个年轻人瑞安·蔡(Ryan Choi)接任他的身份后，回过一次地球。在帮助他的继任者拯救常青藤镇以后，他又回了多元宇宙，将他的城市交给了这个新的、可靠的英雄。
在最终危机(Final Crisis)期间，帕尔默回到主世界帮助瑞安疏散最后的自由的人类。
在正义联盟:正义的呐喊(Justice League:Cry for Justice)中，帕尔默出现与瑞安共事，且被确证将成为哈尔·乔丹(Hal Jordan)的新正义联盟的成员。
在新52的时间线中，帕尔默在"弗兰肯斯坦:暗影局特工(Frankenstein : Agent of S.H.A.D.E)"以暗影局的科学顾问的身份出现。
二代原子侠雷·帕尔默可以随意改变身体大小。
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