理论学习结束之后，接下来就是体能强化阶段。学员们会被植入与飞船相连的数据接口，浸泡在感知剥夺水柜中长达数天，期间还会针对人造虫洞或者跃迁通道的适应性训练，人为制造身体过载和数据过载状况，以考验学员的耐受能力。
这项有可能导致永久性生理创伤和理智摧残的体能训练是成为一名克隆飞行员的最大难关，许多无法忍受煎熬的学员会签下终止协议，剩下的坚持者中会有十分之一在这项培训中失去生命。还是死了白死，没有任何补偿。
对于那些顽强生存下来的幸运儿而言，这一切的付出都是值得的。在最后两年的学习中，他们将学习成为一名合格克隆飞行员所需的所有知识，包括外置武器配置理论、跃迁装置、护盾系统操纵、信号分析学、天文测量学和其它相关技能。
头一年只会在模拟器上不断锻炼自己和飞船主脑的协调能力，到了第二年才会第一次在护卫舰上得到实操机会，同时也是最后一次考核。
终于，在5到6年的砺炼之后，最终的测试来临了，但却不测试任何技能或知识，而是拷问人心。
想毕业、想成为克隆飞行员，就得签下自愿安乐死确认书，放弃受之父母的身体发肤，将意识转移到一具人工制造出来的克隆体内，从此永无回头之路！
最后这项考核才是淘汰率最高的环节，往往能通过各种磨难的优秀学员，确无法接受这种生活，只要稍有犹豫，就会被剥夺毕业资格。
最终能成为克隆飞行员的比例不足第一阶段考核合格者的5%，和申请人数比起来，估计得是万分之几的通过率了，再和想成为克隆飞行员的人数比，恐怕得千万分之几了吧。新伊甸世界里有上千亿人口，克隆飞行员的数量攒了十多年才不到五十万。
洪涛倒不是生气如此低的通过率，而是气自己连通过申请的机会都没有，一切只能停留在想想的阶段，而且在很长时间内都不会有太大改观。
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